Ang isa sa mga application na pinaka apektado sa mga kamakailang kaso ng terorismo dahil sa pag-encrypt ng kanilang mga komunikasyon ay ang Telegram, na ayon sa ilang media, ay naging paboritong channel ng mga terorista upang makipag-usap. Umusbong muli ang kontrobersya matapos ipagbawal ng gobyerno ng Indonesia ang serbisyo sa buong bansa sa pamamagitan ng pagtanggi sa serbisyo ng courier na alisin ang mga pampublikong channel na nauugnay sa terorismo. Sa wakas, tila ang lahat ay naging isang error sa komunikasyon sa pagitan ng gobyerno at ng platform, hindi bababa sa iyan ang sinabi ni Pavel Durov, tagapagtatag ng application na ito.
Ang Indonesia ay tahanan ng pinakamaraming populasyon na nagmula sa Muslim, at unti unting nakita ng gobyerno ang Islamic radicalism na nagiging isang lumalaking problema na nais nilang talakayin sa lalong madaling panahon. Noong nakaraang Biyernes hinarang ng mga awtoridad ng Indonesia ang pag-access sa Telegram, na sinasabi na ang app ay may maraming mga pampublikong channel kung saan natupad ang radikal na propaganda ng terorismong Islam.
Isang araw matapos hadlangan ang serbisyo, sinabi ng ministro ng komunikasyon ng bansa na si Rudiantara, sa Reuters na ang Telegram hindi naproseso ng gobyerno ang kahilingang matanggal nang mabilis ang mga radical channel, bilang karagdagan sa isinasaad na nais nilang makipagtulungan sa ganitong uri ng kumpanya ngunit kailangan din nilang malaman kung saan sila dapat pumunta upang magawa ang kanilang mga kahilingan at natupad sila sa lalong madaling panahon.
Ang nagtatag ng platform ng pagmemensahe na ito, ay nagpapatunay na ang lahat ay hindi pagkakaunawaan sa pagitan ng mga awtoridad at ng kumpanya, na nagsasaad na hindi sila nakatanggap ng anumang komunikasyon na humihiling sa pagtanggal ng mga channel na ito. Sa parehong pahayag, pinatunayan ni Pavel na "Telegram ay malakas na naka-encrypt at nakatuon sa privacy ngunit hindi kami kaibigan ng mga terorista" at magpapatuloy sila sa pakikipag-ugnay sa gobyerno ng bansa upang matanggal ang anumang uri ng pampublikong channel na naghihikayat sa terorismo sa bansa.